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1、真正拥有自主知识产权、国内外首创的“国家一类新药”，只有白云山独家抗生素品种头孢硫眯一项。
2、股份公司与北京大学药学院联合研制国内一类新药——溶栓拟肽LKS—10已进入临床前研究阶段；该项目已先后被列为国家“973”重大项目、国家“1035”重点创新药物工程、国家“985”重大科技攻关行动计划以及2002年广州市唯一重大科技攻关项目，并获得100万资金的资助，此项目已申请了国家发明专利，白云山公司为专利权人。
3、白云山中药厂与中国药科大学合作共建“板蓝根”药材GAP基地、与广州中医药大学合作共建“穿心莲”药材GAP基地，与第一军医大学合作
进行“丹参”中药材有效成分的研究。
4、由广州白云山化学药厂采用具有活性功能的新型头孢菌素母核为起始原料，以独特的合成工艺路线制备的第三代头孢类抗生素头孢他啶原料药具有独创性，其工艺路线和技术指标均达国际先进水平，工业化生产研究已通过广州市科技局的技术鉴定。
5、明兴制药厂与广州拜迪公司联合研制的一类新药--假单孢菌活性蛋白进入临床前研究。
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